Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms