Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU7

Bap1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap1Q99PU7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Bap1Q99PU7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Bap1Q99PU7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms