Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Trim12aQ99PQ1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trim12aQ99PQ1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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