Protein–RNA interactions for Protein: Q99PI4

Lpin3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpin3Q99PI4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lpin3Q99PI4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lpin3Q99PI4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms