Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GpnmbQ99P91 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms