Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms