Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NsmfQ99NF2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NsmfQ99NF2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NsmfQ99NF2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms