Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Bco2Q99NF1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Bco2Q99NF1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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