Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atoh8Q99NA2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms