Protein–RNA interactions for Protein: Q99N43

Kremen1, Kremen protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kremen1Q99N43 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kremen1Q99N43 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kremen1Q99N43 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms