Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac9Q99N13 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac9Q99N13 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms