Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP8

Brap, BRCA1-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrapQ99MP8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BrapQ99MP8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BrapQ99MP8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BrapQ99MP8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms