Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Atp1b4Q99ME6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Atp1b4Q99ME6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atp1b4Q99ME6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms