Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sh3bp5lQ99LH9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sh3bp5lQ99LH9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms