Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tnpo2Q99LG2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnpo2Q99LG2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnpo2Q99LG2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnpo2Q99LG2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnpo2Q99LG2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnpo2Q99LG2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnpo2Q99LG2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnpo2Q99LG2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnpo2Q99LG2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnpo2Q99LG2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnpo2Q99LG2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tnpo2Q99LG2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnpo2Q99LG2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnpo2Q99LG2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnpo2Q99LG2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnpo2Q99LG2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnpo2Q99LG2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tnpo2Q99LG2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tnpo2Q99LG2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tnpo2Q99LG2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnpo2Q99LG2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnpo2Q99LG2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnpo2Q99LG2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnpo2Q99LG2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnpo2Q99LG2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnpo2Q99LG2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnpo2Q99LG2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tnpo2Q99LG2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnpo2Q99LG2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnpo2Q99LG2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnpo2Q99LG2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tnpo2Q99LG2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnpo2Q99LG2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnpo2Q99LG2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnpo2Q99LG2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnpo2Q99LG2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnpo2Q99LG2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tnpo2Q99LG2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms