Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Clint1Q99KN9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clint1Q99KN9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms