Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Reep3Q99KK1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Reep3Q99KK1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms