Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TrabdQ99JY4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TrabdQ99JY4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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