Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lims1Q99JW4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lims1Q99JW4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms