Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pacsin3Q99JB8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pacsin3Q99JB8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms