Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ddb2Q99J79 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddb2Q99J79 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms