Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sf3b5Q923D4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sf3b5Q923D4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sf3b5Q923D4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sf3b5Q923D4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sf3b5Q923D4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b5Q923D4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b5Q923D4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b5Q923D4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b5Q923D4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b5Q923D4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sf3b5Q923D4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms