Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf3Q922U1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Prpf3Q922U1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prpf3Q922U1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms