Protein–RNA interactions for Protein: Q920N2

Hlcs, Biotin--protein ligase, mousemouse

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Length 722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HlcsQ920N2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HlcsQ920N2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HlcsQ920N2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HlcsQ920N2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HlcsQ920N2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HlcsQ920N2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HlcsQ920N2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HlcsQ920N2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HlcsQ920N2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HlcsQ920N2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HlcsQ920N2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HlcsQ920N2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HlcsQ920N2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HlcsQ920N2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HlcsQ920N2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HlcsQ920N2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HlcsQ920N2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HlcsQ920N2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HlcsQ920N2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HlcsQ920N2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HlcsQ920N2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HlcsQ920N2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HlcsQ920N2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HlcsQ920N2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HlcsQ920N2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HlcsQ920N2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HlcsQ920N2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HlcsQ920N2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HlcsQ920N2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HlcsQ920N2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HlcsQ920N2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HlcsQ920N2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HlcsQ920N2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HlcsQ920N2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HlcsQ920N2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HlcsQ920N2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms