Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Trpm2Q91YD4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trpm2Q91YD4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trpm2Q91YD4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trpm2Q91YD4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trpm2Q91YD4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trpm2Q91YD4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trpm2Q91YD4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Trpm2Q91YD4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trpm2Q91YD4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trpm2Q91YD4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trpm2Q91YD4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trpm2Q91YD4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trpm2Q91YD4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trpm2Q91YD4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Trpm2Q91YD4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trpm2Q91YD4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trpm2Q91YD4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trpm2Q91YD4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trpm2Q91YD4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trpm2Q91YD4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trpm2Q91YD4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trpm2Q91YD4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trpm2Q91YD4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trpm2Q91YD4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trpm2Q91YD4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trpm2Q91YD4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trpm2Q91YD4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trpm2Q91YD4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Trpm2Q91YD4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Trpm2Q91YD4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trpm2Q91YD4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms