Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usb1Q91W78 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms