Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIK3

H1foo, Histone H1oo, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H1fooQ8VIK3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H1fooQ8VIK3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H1fooQ8VIK3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H1fooQ8VIK3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H1fooQ8VIK3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H1fooQ8VIK3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H1fooQ8VIK3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H1fooQ8VIK3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
H1fooQ8VIK3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H1fooQ8VIK3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H1fooQ8VIK3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H1fooQ8VIK3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H1fooQ8VIK3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H1fooQ8VIK3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H1fooQ8VIK3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H1fooQ8VIK3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H1fooQ8VIK3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H1fooQ8VIK3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H1fooQ8VIK3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H1fooQ8VIK3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H1fooQ8VIK3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H1fooQ8VIK3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H1fooQ8VIK3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H1fooQ8VIK3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H1fooQ8VIK3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H1fooQ8VIK3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
H1fooQ8VIK3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H1fooQ8VIK3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H1fooQ8VIK3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H1fooQ8VIK3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms