Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI88

Odf4, Outer dense fiber protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf4Q8VI88 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Odf4Q8VI88 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Odf4Q8VI88 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Odf4Q8VI88 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Odf4Q8VI88 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Odf4Q8VI88 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Odf4Q8VI88 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Odf4Q8VI88 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Odf4Q8VI88 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Odf4Q8VI88 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Odf4Q8VI88 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Odf4Q8VI88 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Odf4Q8VI88 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Odf4Q8VI88 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Odf4Q8VI88 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Odf4Q8VI88 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Odf4Q8VI88 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Odf4Q8VI88 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Odf4Q8VI88 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Odf4Q8VI88 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Odf4Q8VI88 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Odf4Q8VI88 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Odf4Q8VI88 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Odf4Q8VI88 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Odf4Q8VI88 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Odf4Q8VI88 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Odf4Q8VI88 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Odf4Q8VI88 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Odf4Q8VI88 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Odf4Q8VI88 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Odf4Q8VI88 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Odf4Q8VI88 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Odf4Q8VI88 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Odf4Q8VI88 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Odf4Q8VI88 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Odf4Q8VI88 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Odf4Q8VI88 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Odf4Q8VI88 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Odf4Q8VI88 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Odf4Q8VI88 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Odf4Q8VI88 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Odf4Q8VI88 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Odf4Q8VI88 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Odf4Q8VI88 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms