Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc71Q8VEG0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms