Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sft2d2Q8VD57 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sft2d2Q8VD57 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms