Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCW2

Krt25, Keratin, type I cytoskeletal 25, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt25Q8VCW2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms