Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4C2

Rufy2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy2Q8R4C2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rufy2Q8R4C2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rufy2Q8R4C2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rufy2Q8R4C2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rufy2Q8R4C2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rufy2Q8R4C2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rufy2Q8R4C2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rufy2Q8R4C2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rufy2Q8R4C2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rufy2Q8R4C2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rufy2Q8R4C2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rufy2Q8R4C2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rufy2Q8R4C2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rufy2Q8R4C2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rufy2Q8R4C2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rufy2Q8R4C2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rufy2Q8R4C2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rufy2Q8R4C2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rufy2Q8R4C2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rufy2Q8R4C2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rufy2Q8R4C2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rufy2Q8R4C2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rufy2Q8R4C2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rufy2Q8R4C2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rufy2Q8R4C2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rufy2Q8R4C2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rufy2Q8R4C2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rufy2Q8R4C2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rufy2Q8R4C2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rufy2Q8R4C2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rufy2Q8R4C2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rufy2Q8R4C2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rufy2Q8R4C2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rufy2Q8R4C2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rufy2Q8R4C2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rufy2Q8R4C2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rufy2Q8R4C2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rufy2Q8R4C2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rufy2Q8R4C2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rufy2Q8R4C2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rufy2Q8R4C2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms