Protein–RNA interactions for Protein: Q8R368

Dnaaf4, Dynein assembly factor 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf4Q8R368 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dnaaf4Q8R368 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Dnaaf4Q8R368 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Dnaaf4Q8R368 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnaaf4Q8R368 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnaaf4Q8R368 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnaaf4Q8R368 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnaaf4Q8R368 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnaaf4Q8R368 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnaaf4Q8R368 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnaaf4Q8R368 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnaaf4Q8R368 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnaaf4Q8R368 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dnaaf4Q8R368 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dnaaf4Q8R368 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dnaaf4Q8R368 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dnaaf4Q8R368 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dnaaf4Q8R368 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dnaaf4Q8R368 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnaaf4Q8R368 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnaaf4Q8R368 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnaaf4Q8R368 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnaaf4Q8R368 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnaaf4Q8R368 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnaaf4Q8R368 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnaaf4Q8R368 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnaaf4Q8R368 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnaaf4Q8R368 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dnaaf4Q8R368 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnaaf4Q8R368 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnaaf4Q8R368 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnaaf4Q8R368 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnaaf4Q8R368 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnaaf4Q8R368 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnaaf4Q8R368 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnaaf4Q8R368 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnaaf4Q8R368 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnaaf4Q8R368 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dnaaf4Q8R368 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnaaf4Q8R368 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnaaf4Q8R368 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnaaf4Q8R368 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dnaaf4Q8R368 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms