Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2T8

Gtf3c5, General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5Q8R2T8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gtf3c5Q8R2T8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gtf3c5Q8R2T8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms