Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r200Q8R281 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r200Q8R281 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r200Q8R281 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vmn1r200Q8R281 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r200Q8R281 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r200Q8R281 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r200Q8R281 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r200Q8R281 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r200Q8R281 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vmn1r200Q8R281 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r200Q8R281 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r200Q8R281 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r200Q8R281 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r200Q8R281 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r200Q8R281 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r200Q8R281 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r200Q8R281 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r200Q8R281 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r200Q8R281 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r200Q8R281 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r200Q8R281 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vmn1r200Q8R281 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r200Q8R281 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vmn1r200Q8R281 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Vmn1r200Q8R281 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Vmn1r200Q8R281 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Vmn1r200Q8R281 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Vmn1r200Q8R281 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Vmn1r200Q8R281 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Vmn1r200Q8R281 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Vmn1r200Q8R281 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Vmn1r200Q8R281 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vmn1r200Q8R281 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.2 ms