Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sf3b4Q8QZY9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sf3b4Q8QZY9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms