Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rdh16f2Q8K3M1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rdh16f2Q8K3M1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms