Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Paf1Q8K2T8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Paf1Q8K2T8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Paf1Q8K2T8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms