Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Abcf3Q8K268 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Abcf3Q8K268 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Abcf3Q8K268 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Abcf3Q8K268 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Abcf3Q8K268 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Abcf3Q8K268 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Abcf3Q8K268 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcf3Q8K268 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcf3Q8K268 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcf3Q8K268 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcf3Q8K268 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcf3Q8K268 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Abcf3Q8K268 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Abcf3Q8K268 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Abcf3Q8K268 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Abcf3Q8K268 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Abcf3Q8K268 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms