Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Prkd3Q8K1Y2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prkd3Q8K1Y2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prkd3Q8K1Y2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms