Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc4a8Q8JZR6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc4a8Q8JZR6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms