Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LgsnQ8CIX8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LgsnQ8CIX8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LgsnQ8CIX8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LgsnQ8CIX8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LgsnQ8CIX8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LgsnQ8CIX8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LgsnQ8CIX8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LgsnQ8CIX8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LgsnQ8CIX8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LgsnQ8CIX8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LgsnQ8CIX8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LgsnQ8CIX8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LgsnQ8CIX8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LgsnQ8CIX8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LgsnQ8CIX8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LgsnQ8CIX8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LgsnQ8CIX8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LgsnQ8CIX8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LgsnQ8CIX8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LgsnQ8CIX8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LgsnQ8CIX8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LgsnQ8CIX8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LgsnQ8CIX8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LgsnQ8CIX8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LgsnQ8CIX8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LgsnQ8CIX8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LgsnQ8CIX8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LgsnQ8CIX8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LgsnQ8CIX8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LgsnQ8CIX8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LgsnQ8CIX8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LgsnQ8CIX8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LgsnQ8CIX8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LgsnQ8CIX8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms