Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Upp2Q8CGR7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms