Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rbm28Q8CGC6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm28Q8CGC6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm28Q8CGC6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm28Q8CGC6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm28Q8CGC6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm28Q8CGC6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm28Q8CGC6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm28Q8CGC6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rbm28Q8CGC6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm28Q8CGC6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm28Q8CGC6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm28Q8CGC6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm28Q8CGC6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm28Q8CGC6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm28Q8CGC6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm28Q8CGC6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm28Q8CGC6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm28Q8CGC6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm28Q8CGC6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm28Q8CGC6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm28Q8CGC6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm28Q8CGC6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm28Q8CGC6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm28Q8CGC6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm28Q8CGC6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm28Q8CGC6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm28Q8CGC6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm28Q8CGC6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm28Q8CGC6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm28Q8CGC6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm28Q8CGC6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm28Q8CGC6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm28Q8CGC6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm28Q8CGC6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm28Q8CGC6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm28Q8CGC6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm28Q8CGC6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm28Q8CGC6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rbm28Q8CGC6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm28Q8CGC6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm28Q8CGC6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm28Q8CGC6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm28Q8CGC6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm28Q8CGC6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm28Q8CGC6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm28Q8CGC6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm28Q8CGC6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm28Q8CGC6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm28Q8CGC6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm28Q8CGC6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm28Q8CGC6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm28Q8CGC6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm28Q8CGC6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm28Q8CGC6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm28Q8CGC6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm28Q8CGC6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm28Q8CGC6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm28Q8CGC6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm28Q8CGC6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm28Q8CGC6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm28Q8CGC6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm28Q8CGC6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm28Q8CGC6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm28Q8CGC6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm28Q8CGC6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm28Q8CGC6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm28Q8CGC6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm28Q8CGC6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm28Q8CGC6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm28Q8CGC6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm28Q8CGC6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm28Q8CGC6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm28Q8CGC6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm28Q8CGC6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm28Q8CGC6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm28Q8CGC6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm28Q8CGC6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm28Q8CGC6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm28Q8CGC6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm28Q8CGC6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm28Q8CGC6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm28Q8CGC6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm28Q8CGC6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rbm28Q8CGC6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbm28Q8CGC6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbm28Q8CGC6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbm28Q8CGC6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbm28Q8CGC6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbm28Q8CGC6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbm28Q8CGC6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbm28Q8CGC6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbm28Q8CGC6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbm28Q8CGC6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbm28Q8CGC6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbm28Q8CGC6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbm28Q8CGC6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbm28Q8CGC6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbm28Q8CGC6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rbm28Q8CGC6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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