Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFF0

Parp11, Poly [ADP-ribose] polymerase 11, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp11Q8CFF0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Parp11Q8CFF0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Parp11Q8CFF0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Parp11Q8CFF0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Parp11Q8CFF0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Parp11Q8CFF0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Parp11Q8CFF0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp11Q8CFF0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp11Q8CFF0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp11Q8CFF0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp11Q8CFF0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp11Q8CFF0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp11Q8CFF0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp11Q8CFF0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp11Q8CFF0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp11Q8CFF0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp11Q8CFF0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp11Q8CFF0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Parp11Q8CFF0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms