Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pramef8Q8CE24 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Pramef8Q8CE24 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pramef8Q8CE24 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pramef8Q8CE24 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms