Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD15

Riox2, Ribosomal oxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox2Q8CD15 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Riox2Q8CD15 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Riox2Q8CD15 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Riox2Q8CD15 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Riox2Q8CD15 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Riox2Q8CD15 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Riox2Q8CD15 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Riox2Q8CD15 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Riox2Q8CD15 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Riox2Q8CD15 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Riox2Q8CD15 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Riox2Q8CD15 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Riox2Q8CD15 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Riox2Q8CD15 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Riox2Q8CD15 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Riox2Q8CD15 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Riox2Q8CD15 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Riox2Q8CD15 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Riox2Q8CD15 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Riox2Q8CD15 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Riox2Q8CD15 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Riox2Q8CD15 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Riox2Q8CD15 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Riox2Q8CD15 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Riox2Q8CD15 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Riox2Q8CD15 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Riox2Q8CD15 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Riox2Q8CD15 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Riox2Q8CD15 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Riox2Q8CD15 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Riox2Q8CD15 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Riox2Q8CD15 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Riox2Q8CD15 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Riox2Q8CD15 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Riox2Q8CD15 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Riox2Q8CD15 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms