Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ufl1Q8CCJ3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ufl1Q8CCJ3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ufl1Q8CCJ3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ufl1Q8CCJ3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ufl1Q8CCJ3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ufl1Q8CCJ3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ufl1Q8CCJ3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ufl1Q8CCJ3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ufl1Q8CCJ3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ufl1Q8CCJ3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ufl1Q8CCJ3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ufl1Q8CCJ3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ufl1Q8CCJ3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ufl1Q8CCJ3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ufl1Q8CCJ3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ufl1Q8CCJ3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ufl1Q8CCJ3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ufl1Q8CCJ3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ufl1Q8CCJ3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ufl1Q8CCJ3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ufl1Q8CCJ3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ufl1Q8CCJ3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ufl1Q8CCJ3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ufl1Q8CCJ3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ufl1Q8CCJ3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ufl1Q8CCJ3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ufl1Q8CCJ3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ufl1Q8CCJ3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ufl1Q8CCJ3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ufl1Q8CCJ3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ufl1Q8CCJ3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms