Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RybpQ8CCI5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RybpQ8CCI5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms