Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spef2Q8C9J3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spef2Q8C9J3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spef2Q8C9J3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spef2Q8C9J3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spef2Q8C9J3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spef2Q8C9J3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spef2Q8C9J3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Spef2Q8C9J3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Spef2Q8C9J3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spef2Q8C9J3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spef2Q8C9J3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spef2Q8C9J3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Spef2Q8C9J3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spef2Q8C9J3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spef2Q8C9J3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Spef2Q8C9J3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spef2Q8C9J3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spef2Q8C9J3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spef2Q8C9J3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Spef2Q8C9J3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spef2Q8C9J3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spef2Q8C9J3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spef2Q8C9J3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spef2Q8C9J3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spef2Q8C9J3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spef2Q8C9J3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Spef2Q8C9J3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Spef2Q8C9J3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spef2Q8C9J3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spef2Q8C9J3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spef2Q8C9J3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Spef2Q8C9J3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Spef2Q8C9J3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Spef2Q8C9J3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Spef2Q8C9J3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Spef2Q8C9J3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Spef2Q8C9J3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Spef2Q8C9J3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Spef2Q8C9J3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Spef2Q8C9J3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Spef2Q8C9J3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Spef2Q8C9J3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Spef2Q8C9J3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Spef2Q8C9J3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Spef2Q8C9J3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Spef2Q8C9J3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Spef2Q8C9J3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Spef2Q8C9J3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Spef2Q8C9J3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Spef2Q8C9J3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Spef2Q8C9J3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Spef2Q8C9J3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Spef2Q8C9J3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Spef2Q8C9J3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Spef2Q8C9J3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Spef2Q8C9J3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Spef2Q8C9J3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Spef2Q8C9J3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Spef2Q8C9J3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Spef2Q8C9J3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Spef2Q8C9J3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Spef2Q8C9J3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Spef2Q8C9J3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Spef2Q8C9J3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Spef2Q8C9J3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Spef2Q8C9J3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Spef2Q8C9J3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Spef2Q8C9J3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Spef2Q8C9J3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Spef2Q8C9J3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Spef2Q8C9J3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Spef2Q8C9J3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Spef2Q8C9J3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Spef2Q8C9J3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Spef2Q8C9J3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Spef2Q8C9J3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Spef2Q8C9J3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Spef2Q8C9J3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Spef2Q8C9J3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Spef2Q8C9J3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Spef2Q8C9J3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Spef2Q8C9J3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Spef2Q8C9J3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Spef2Q8C9J3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Spef2Q8C9J3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Spef2Q8C9J3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Spef2Q8C9J3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Spef2Q8C9J3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Spef2Q8C9J3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Spef2Q8C9J3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Spef2Q8C9J3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Spef2Q8C9J3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Spef2Q8C9J3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Spef2Q8C9J3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Spef2Q8C9J3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Spef2Q8C9J3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Spef2Q8C9J3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Spef2Q8C9J3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Spef2Q8C9J3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms